如前所述，必須氨基酸含量越高的蛋白，增肌的效果會越好。含有所有 9 種必須氨基酸的蛋白質又稱爲完全蛋白，目前市面上用來做成蛋白粉的乳清、豌豆和大豆都屬於完全蛋白，但由於蛋白粉都是經過加工的產品，因此實際上氨基酸的含量還是會有所落差。購買前記得仔細檢查包裝上的營養成分標示，確定蛋白粉中含有足量的必須氨基酸。
前面提過，在所有必須氨基酸中，支鏈氨基酸對肌蛋白的合成最爲重要，因此，要挑選增肌效果好的蛋白粉，當然要以支鏈氨基酸含量越高的產品爲主。支鏈氨基酸的含量，在不同品牌間差異很大。很多人會以爲乳清蛋白的支鏈氨基酸含量一定最高，但其實到市面上比較一輪，就知道實際情況並非如此，很多豌豆蛋白的支鏈胺基酸含量反而比乳清蛋白還高，購買前建議先多做比較。
目前市面上大部分蛋白粉都還是以乳清蛋白爲主，然而根據研究，成年人至少一半以上都有乳糖不耐症的困擾。在有乳糖不耐症的情況下，喝乳清蛋白容易造成腹瀉、腸胃不適等問題，並影響身體對蛋白質的吸收。不少人喝了很長時間的乳清蛋白，卻還是看不到增肌的效果，很有可能就是因爲身體有乳糖不耐症，無法完整吸收乳清蛋白的結果。如果乳清蛋白無法讓你達到預期的增肌成效，不妨試試豌豆蛋白等不含乳糖的植物性蛋白。
除了乳清蛋白中的乳糖可能會對有乳糖不耐症的人造成副作用之外，有些人對乳糖或大豆蛋白也會產生過敏反應。此外，大豆雖然蛋白質營養高，卻容易引起脹氣，影響運動表現，腸胃敏感的人須特別留意。
不少運動吃蛋白的人也將蛋白粉當做減肥飲食計畫的一部分。想達到更好的減重成效，最好選擇含有豐富膳食纖維的蛋白粉，可以增加蛋白質提升飽足感的效果。植物性蛋白中的膳食纖維含量一般比乳清蛋白高。此外，植物性蛋白的膽固醇和脂肪含量較低，因此一般熱量也比動物性蛋白低，適合減重人士。
