小兒慢性胃炎最明顯的症狀就是消化不良，經常會有便祕或者腹瀉等症狀，吃東西后經常排氣、肚子發脹、不消化；有的會有積食，發燒等症狀。長期消化不良，會導致孩子出現腹痛、腹瀉等症狀，早期腹痛一般不算明顯，但是按壓時通常會有鈍痛感。炎症發作嚴重的還會噁心、嘔吐，甚至上吐下瀉和進食困難。
慢性胃炎如果沒有得到及時的治療，炎症反覆發作，會影響孩子的食慾，吃東西的時候感覺噁心，身體的不適也會引起情緒不佳，甚至煩躁、哭鬧。長期沒有食慾，會影響孩子的正常發育，營養跟不上，容易出現體重明顯減輕、消瘦、臉色蒼白等症狀，嚴重的還會貧血。
慢性胃炎還表現爲大便異常，有的患兒經常便祕，大便發黑，味道比較臭；單純大便發黑不一定就確定是慢性胃炎，需要結合其他的症狀來判斷。如有這些症狀表現，應及時到醫院檢查，不要亂用藥物，藥物不對症，不僅不能緩解症狀，還可能引起其他問題出現。
小兒慢性胃炎還會出現反覆腹痛的症狀，通常這種疼痛並沒有規律性，大多會在進食後出現症狀加重的現象。而且疼痛部位也不明確，大多數患兒會感覺臍周疼痛。當小嬰兒出現腹痛時，他們通常會表現的特別不安，而且會影響正常進食，除此之外，在臨牀上，有些患兒還會出現不同程度的噯氣、早飽、噁心、反酸等症狀。如果吃硬、冷、辛辣等食物，會加重疾病的症狀。
部分小兒慢性胃炎患兒會出現食慾不振、乏力、消瘦及頭暈等症狀，如果出現胃糜爛的患兒可能會出現黑便體徵，但是這種症狀不是很明顯，在做檢查時可以發現壓痛，其部位可在中上腹或臍周，而且範圍較廣泛。
