用紅曲米給菜餚調色時，用量一般不宜過多，以免導致菜餚味道發苦。
這種情況加點糖，可起到去酸解苦的作用。
紅曲米中含有較多的蛋白質，而山楂中含有熊果酸、齊墩果酸、山楂酸、綠原酸等植物酸。若二者同食，這些植物酸會和蛋白質結合，生成難以溶解的絡合物，難以被胃腸消化吸收，可能會引起消化不良、便祕。
正在服用降脂藥得患者不應該同時食用紅曲米，因爲降脂藥物本身就能降低膽固醇。
同時紅曲米還不能與史塔丁類藥物一起服用，因爲紅曲米和史塔丁類藥物都有導致頭暈、胃燒感、肝臟損壞的副作用。
1、紅曲米有活血化瘀功效，孕婦吃多了可能導致流產，尤其是孕早期時，所以孕婦不宜吃。
2、紅曲能健脾消食，治療食積滯，也就是能快速促進消化。脾陰不足者脾氣兩虛不足，精力不足，肌不欲食，食用後會加重身體不適，也應慎吃。
3、曲米主治飲食積滯、脘腹脹滿，促進人體消化和吸收，能加快新陳代謝。對於無食積滯者來說不需要服用，服用後可能會不好，要慎吃。
紅曲米易受潮，一旦受潮，就會受到有害微生物的侵染，逐漸黴變，結塊生蟲，這樣的再食用對健康不利，不宜再吃。而儲存時，應當放在乾燥的環境裏，避免受潮。
