1、染色體異常：性染色體異常可使睾丸等性器官分化不良，造成真性兩性畸形和先天性睾丸發育不全等。常染色體異常可導致性腺及生精細胞代謝紊亂。
2、局部病變：如隱性精索靜脈曲張、巨大鞘膜積液等疾病影響了睾丸局部的外環境，或因溫度、壓迫等原因造成不育。
3、染色體異常：性染色體異常可使睾丸等性器官分化不良，造成真性兩性畸形和先天性睾丸發育不全等。常染色體異常可導致性腺及生精細胞代謝紊亂。
附屬腺包括前列腺和精囊腺，附屬腺是男性生殖系統中非常重要的一部分，附屬腺異常即前列腺和精囊腺的功能發生異常而導致男性不育症的發生。
1、睾丸異常：睾丸異常有3種情況：①隱睾，不僅導致不孕，還可誘發惡變;②胎兒期因不利的環境因素損傷了胚原基;③早期睾丸損傷，可因分娩過程中產傷引起。
2、 染色體異常：如兩性畸形、生殖器官發良異常等。
3、 鞘膜積液：鞘膜積液壓迫了睾丸血液循環，可導致睾丸感染或萎縮。該病青春期後發病率爲16%—19%。
4、 生殖器官感染：細菌、病毒、原蟲等感染，可以直接損害睾丸，嚴重地影響生精能力及降低精子的活性而導致不孕。例如青春發育前期患腮腺炎有20%併發睾丸炎而造成不育。
5、 睾丸後天損傷：如疝氣修補術、鞘膜積液手術、睾丸固定手術等損傷了睾丸血管，阻礙血供而使睾丸萎縮。
睾丸的功能是產生精子，從而保證人類種族的延續。因此，無論是先天發育障礙還是後天的衆多因素引起的睾丸的病變，均可以導致不育症。
附睾炎
睾丸的周圍後緣即是附睾，精子生產後暫時貯存在這裏。附睾炎，30歲左右的人多見，大多是由於遲遲不愈的尿路又被細菌感染，致使病菌經輸精管管腔進入附睾。它常跟着後尿道炎、前列腺炎、精囊炎等發生。部位可單側可雙側，發作時間可急可緩。
睾丸炎
多因附睾炎直接蔓延至睾丸所致，由細菌引起。而兒童急性睾丸炎通常是流行性腮腺炎病毒引起的。
睾丸瘀傷
睾丸發生損傷時，局部會有腫脹及瘀血。又因爲陰囊面板鬆弛，睾丸血液迴流豐富，損傷後極易引起血腫，感染。劇烈運動或性行爲、暴力有時可引起提睾肌的強烈收縮，讓睾丸“雪上加霜”。外傷之後，如果供應睾丸營養的血管損傷嚴重，它會萎縮、壞死，引起陽痿或性功能障礙。
陰囊水囊腫
由包在某一個或兩個睾丸的薄膜層之間組織水製造過剩引起。有時會發生在一次睾丸受傷或睾丸炎之後，但大多數情況根本找不出任何原因。
精子是經過輸精管、射精管以及尿道，將成熟的精子送出體外。只要任何一處發生阻塞，精子的排出和執行就會發生障礙，導致不育。
1、泌尿生殖系統的感染：如附睾炎、前列腺炎、精囊炎或附睾輸精管結核等，造成輸精管道梗阻，以附睾與輸精管連接部較多見。
2、腫瘤：如附睾腫瘤、精囊腫瘤、前列腺腫瘤等，均可造成輸精管道阻塞。
3、由手術損傷造成：如疝修補術、精索靜脈曲張、精索腫瘤手術等可傷及輸精管;附睾精液囊腫、睾丸鞘膜積液手術， 可傷及附睾;前列腺手術可引起射精管口閉塞;或雖無直接損傷，但術後感染粘連疤痕形成等均可使輸精管道受壓、梗阻。
4、先天性畸形：如附睾頭、體、尾段缺如，輸精管一段或完全缺如，輸精管與附睾不連接，附睾、輸精管或精囊發育不全等。
精液異常分爲精液異常和精子異常兩類，前者指精液量的多寡，顏色異常、質的異常，後者指精子量的多少，質的異常、畸形等。
1、精子質量差 精液中無活力的或死精子過多(超過20%)，或精子活動能力很差或畸形精子超過30%，常可造成不育。
2、精液理化性狀異常 正常精液射出後很快凝成膠凍狀，在以後的15～30分鐘內又全部液化。如果精液射出後不凝固，或液化不全常提示精囊或前列腺有病變。細菌、病毒感染生殖道也可造成精液成分的改變以致引起不育。
3、無精子或精子過少 精液中精子密度低於0.2×10[9] /ml時女方受孕機會減少，造成不育。這種不育可分爲永久性和暫時性，前者見於先天性睾丸發育障礙或睾丸、精囊嚴重病變者;後者多見於性生活過頻導致生精功能一度衰竭，一般爲精子減少而不是全無精子。
垂體性侏儒症
臨牀表現：軀體生長遲緩，身體矮小，成年人身高不足130cm;面板細膩，毛髮少而軟;骨骼發育遲緩，骨齡延遲2年以上，骨骺融合較晚;性器官不發育，缺乏第二性徵，陰莖細小如嬰幼兒時期，睾丸小如黃豆狀，多出現隱睾;無性慾，無精子生成，鬍鬚、腋毛、陰毛均不生長，聲調似兒童;但智力與年齡相稱。
原發性腎上腺皮質功能減退症
原發性腎上腺皮質功能減退症亦稱Addison病，是由腎上腺皮質萎縮或被破壞引起皮質醇或醛固酮缺乏所致，這類患者可有性慾衰減的表現，睾酮合成減少、精子生成障礙，而發生少精症或無精症。患者多有陽萎症狀而影響性生活。
肢端肥大症和巨人症
臨牀表現：面板增厚、油膩、毛髮增多;手足粗大肥厚;舌、脣、耳肥大;顱骨、上頜、前額、眉弓、枕骨粗隆增大，下頜前伸、下牙前錯，容貌醜陋;心臟肥大，易發生快速心律失常、心力衰竭;頭痛、精神狀態不穩定、暴躁易怒、多汗、全身肌無力;男性在發病早期，性慾可增強，但以後逐漸減退、外生殖器萎縮、陽痿以致不育。
精索靜脈曲張是指精索裏的靜脈因迴流受阻，而出現的盤曲擴張。精索靜脈血流淤積而造成精索蔓狀叢(靜脈血管叢)血管擴張，迂曲和變長。
正常人體睾丸的血管系統有兩種，一是爲睾丸提供新鮮血液的動脈系統，將含有營養成分的新鮮血液引入睾丸，保障睾丸的新陳代謝需要;二是靜脈系統，其功能爲將用過的血液從睾丸引出，這些血液進一步迴流到大的靜脈，與許多臟器使用過的血液一起匯入到肺循環再次吸取新鮮的氧等營養物。
但在部分人中，靜脈局部血液的淤積使睾丸內的血液不能順利流出，造成睾丸內大量陳舊血液的淤積，使新鮮的動脈血不能進入睾丸，同時睾丸內溫度升高。影響睾丸的新陳代謝，使睾丸發育受到嚴重損傷。在精索靜脈曲張的早期可能無任何臨牀症狀，隨着病情的進一步發展，逐步出現睾丸疼痛，在局部可摸到曲張、迂曲的靜脈團，睾丸變軟直至睾丸萎縮。
1、逆行射精 膀胱頸部曾做過手術或受到損傷或手術後瘢痕攣縮使尿道畸形變，雙側腰交感神經切除術後或直腸癌腹會陰手術後，糖尿病引起的陰部神經損害，精索囊腫肥大，以及嚴重尿道狹窄，某些藥物可引起支配膀胱的交感神經功能改變。
2、精道梗阻 先天性輸精管道的缺如閉鎖等畸形，手術結紮輸精管，精道及其周圍組織的慢性炎症等。
3、外生殖器異常 如先天性陰莖缺、如陰莖過小、男性假兩性畸形、尿道上裂或下裂、後天性陰莖炎症或損傷、陰囊水腫、巨大睾丸鞘膜積液等，例如陽痿就是男性不育的原因之一，因爲精子沒有辦法正常射入陰道內與卵子相遇。
不良的生活習慣，也是導致男性不育的原因之一，是因爲男性在日常生活中，受各方面的影響。如抽菸、飲酒、暴飲暴食、長期喝濃咖啡、性生活不潔或氾濫等等。在不知不覺中，使得部分男性的生育能力低下，甚至導致不育。
過度手淫可造成男性不育，據統計，95%以上的男性在青少年時期有過手淫,這樣是否會導致不育症?專家指出手淫並不可怕，也不必過分擔憂，青少年偶爾有手淫發生並不是什麼反常、不道德和值得羞愧的事情，決不會對青少年的身心產生什麼重要的影響。並且調查表明在有過手淫習慣的人中，90%以上男性具有正常生育力。因此擁有手淫習慣的人放下心理負擔，多瞭解關於性的知識，糾正習慣，避免過度手淫。
生活環境，工作環境，還有受到生活上的壓力、男性心理的壓力、先天的遺傳等各種其他因素都有可能導致男性不育。
鴛鴦浴導致男性不育，衆所周知，男性的睾丸位於陰囊中，而常溫下陰囊的溫度要比體溫低3度左右。從生理上來講，陰囊溫度低於體溫有利於睾丸“生產”出高質量的精子，並能保證有足夠健康活潑的精子讓卵子受精。
美國紐約大學的泌尿學工作者，早年就發現大量的不孕不育症患者，男士的陰囊溫度高於正常人陰囊溫度，特別是有特發性不育症或精索靜脈曲張的男子，其睾丸的溫度比有生育能力的男子爲高。
近20年來，人類精子數量仍以平均每年2%的速度下降，這很大部分的因素跟環境不斷惡化、不良的生活方式等有關。臨牀發現，不良的生活方式與行爲不僅影響男性的精子質量的同時，也將影響正在治療患者的療效。不良的生活方式，也就是男人日常的不恰當的“衣、食、住、行”會嚴重影響健康。爲了保持正常精子質量及其生育功能，男性應該引起足夠重視，改變一些不良生活習慣。
