止咳丸的副作用尚不明確。
止咳丸含有麻黃、紫蘇子、厚朴(姜炙)、葶藶子、川貝母、法半夏(砂炒)、白果、罌 粟殼、硼砂、枳殼(麩炒)、陳皮、桔梗等22味中藥成分。止咳丸的成分都是常見的中藥材，毒副作用不明顯，目前止咳丸副作用還不明確。如在服用止咳丸期間出現不良症狀，應停藥或立即諮詢醫生。
1.忌菸、酒及辛辣、生冷、油膩食物。
2.不宜在服藥期間同時服用滋補性中藥。
3.有支氣管擴張、肺膿瘍、肺心病、肺結核患者出現咳嗽時應去醫院就診。
4.高血壓、心臟病患者慎服。
5.本品不宜長期服用，用藥3天症狀無緩解，應去醫院就診。
6.嚴格按用法用量服用，年老體弱者應在醫師指導下服用。
7.對本品過敏者禁用，過敏體質者慎用。
8.本品性狀發生改變時禁止使用。
9.兒童必須在成人監護下使用。
10.請將本品放在兒童不能接觸的地方。
11.如正在使用其他藥品，使用本品前請諮詢醫師或藥師。
