在園在校學生：
按學年一次性繳納醫療保險費，參保學生應將醫療保險費繳交到學校，學校統一歸集。
非在園在校少兒(深戶籍)：
由社保機構一次性從監護人或少兒本人的繳費帳戶中扣取全年費用。
① 在2016年4月14日之後激活了參保人本人的金融社保卡，將自動強制使用本人的金融社保卡作爲繳費帳戶，未激活使用的將繼續使用監護人(大學生爲本人)的銀行帳戶繳費;
② 在2016年4月14日之前激活了本人金融社保卡的，但事後透過銀行視窗、社保局個人網頁、微信等渠道確認將金融社保卡作爲社保帳戶的，也將自動強制使用本人的金融社保卡作爲繳費帳戶。
符合少兒醫保參保條件的參保人蔘加基本醫保二檔。
繳費標準爲：
深圳市上年度在崗職工月平均工資*0.8%*繳費月數。
2019-2020年度爲：
893.64元(9309×0.8%×12個月)
其中財政爲每位少兒醫保參保人補貼522元/年，參保人實際需繳交醫療保險費371.64元。(比上一年度的309.36略多)
