有傳統的水煮方法來消毒，其原理是將水煮沸到100℃，透過高溫來消毒奶瓶。這種消毒方法適宜消毒耐高溫120℃以上的器皿。其鍋身爲不鏽鋼材質，配備的奶瓶盛放籃，可盛放6只左右的奶瓶。
使用方法：先用盛放籃裝好洗淨的奶瓶，放入鍋內，再往鍋內注入沒過奶瓶高度的水,蓋上蓋。再將奶瓶消毒鍋放入煤氣爐或電磁爐上加熱10分鐘即可。
採用100℃的高溫蒸汽消毒奶瓶及小配件，是目前使用最廣泛，消毒效果最徹底、最有效的方法，國家餐具消毒標準採納了這種方法，醫療器具的消毒標準是在餐具消毒標準基礎上提高了消毒環境的壓力和溫度。這類消毒器對待消毒器具的結構、透光性沒有苛刻的要求，及其適合消毒小孩的奶瓶、餐具。
使用方法：先往蒸發皿注入100ml左右的水，將洗淨的奶瓶倒置放入奶瓶消毒器的盛放籃，置入消毒器內，接着放入小件盛放籃，將奶嘴等小部件放入其中，蓋上蓋。接通電源後，按下消毒鍵即可，15分鐘後消毒完畢。
採用蒸汽消毒法消毒完的奶瓶，奶瓶壁會附上大量水珠， 潮溼的環境容易造成細菌繁殖，爲了提高奶瓶的保潔時間，這類產品在普通蒸汽奶瓶消毒器的基礎上增加了烘乾功能，也就是常說的烘乾奶瓶消毒器。
使用方法：先往蒸發皿注入100ml左右的水，將洗淨的奶瓶放入奶瓶消毒器盛放籃，置入消毒器內，接着放入小件盛放籃，將奶嘴等小部件放入其中，蓋上蓋。接通電源後，按下消毒鍵即可，一鍵控制，蒸汽消毒器消毒後它會自動對奶瓶進行烘乾。
微波爐奶瓶消毒器其本身並不具有任何消毒功能，它其實是一個盛放奶瓶的器具，也可叫奶瓶消毒盒，透過將其放入微波爐加熱，產生水蒸汽來消毒奶瓶。
使用方法：先往奶瓶消毒盒內注入200ml的水，將洗淨的奶瓶放入其中，蓋上蓋，再將消毒盒置入微波爐托盤中央，關上微波爐，定時四分鐘即可。
紫外線奶瓶消毒器
紫外線輻照能量低，穿透力弱，僅能殺滅直接照射到的微生物，因此消毒時必須使消毒部位充分暴露於紫外線下。紫外線消毒的最適宜溫度範圍是20-40℃，溫度過高或過低均會影響消毒效果。
使用方法：將洗淨的奶瓶及其奶嘴小部件放入紫外線消毒器內，按下消毒鍵即可。
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