黃連素又稱“鹽酸小檗鹼”。它是從黃連、黃檗中提煉出來的一種抗菌性生物鹼，對痢疾桿菌、結核桿菌、肺炎球菌、金黃色葡萄球菌、鏈球菌、傷寒桿菌、白喉桿菌、阿米巴原蟲等均有抑制作用，以對痢疾桿菌的抑制作用最強。專家們經過藥理研究證實，鹽酸小檗鹼不但能抑制某些細菌和原蟲生長，還增強白細胞吞噬細菌的能力。
但不知從何時起，許多人一有腹瀉，馬上就會服用黃連素，黃連素竟成了醫治腹瀉的“萬靈藥”。
實際上，鹽酸小檗鹼口服吸收極差，其成分幾乎均停留在胃腸道，不易透過胃腸道進入血液，故對一些有全身性疾病的患者力所不及，而對胃腸炎、細菌性痢疾等消化道炎症性疾病有特效。對非感染性的腹瀉、腹痛，如胃腸功能紊亂、腸激惹症、過敏性腸炎和心因性腹瀉等，鹽酸小檗鹼是毫無作用的。
部分患者口服鹽酸小檗鹼後會出現噁心、嘔吐、皮疹和藥物熱，經常服用易產生耐藥性。將其作爲腹瀉、腹痛的“萬靈藥”，而不問青紅皁白，不明確病因，有時不僅不能消除腹瀉、腹痛，甚至還會加重病情。腹瀉、腹痛是否需要用鹽酸小檗鹼，應該經大便檢查後再結合患者其他症狀體徵再行決定。
